När 99,1 procent av rösterna räknats hade Santos fått 46,6 procent av dem och Mockus 21,5 procent, rapporterade AFP.

Närmare hälften av Colombias nära 30 miljoner väljare deltog i söndagsvalet, meddelade landets valmyndighet.

Båda har lovat att fortsätta president Alvaro Uribes linje med marknadsekonomi och hårdför säkerhetspolitik. Santos har dock starkare stöd på landsbygden där vänstergerillan Farcs kidnappningar och högermilisernas terror tidigare har plågat invånarna. Mockus tilltalar främst yngre väljare i storstäder.

Uribes företagarvänliga politik under åtta år på presidentposten har fått utländska investeringar att öka femfaldigt. Men ekonomin är fortfarande trög och arbetslösheten tvåsiffrig. Frågor om jobb, skolor och sjukvård dominerade valkampanjerna.

Colombia är Latinamerikas fjärde största oljeproducent och stor exportör av kol och kaffe. Investeringarna görs mest i energi- och gruvsektorn.

Den 20 juni står slutstriden mellan de båda.