Enligt en källa i rysk rymdindustri siktades rymdsoporna för sent för att man skulle kunna göra en undanmanöver.
Rymdskrotet var nära att träffa ISS. Avståndet till föremålet - oklart vad det var - ska ha varit så litet som 250 meter.
Besättningen fick kort efteråt klartecken för att lämna räddningsfarkosterna.
Skrotpassagen inträffade omkring halv tre på eftermiddagen svensk tid. Därefter fick besättningen enligt nyhetsbyrån Ria Novosti återgå till sina ordinarie arbetsuppgifter.
En tjänsteman vid rymdkontrollen uppgav för nyhetsbyrån AFP att det inte var en direkt nödsituation. Enligt henne har besättningen stående instruktioner om att evakuera rymdstationen i liknande lägen.
Minst en snarlik incident har inträffat tidigare, i mars 2009.
Kosmonauterna och astronauterna ombord - just nu tre ryssar och två amerikaner - har också sällskap av en japan.
ISS rör sig omkring 35 mil ovanför jordytan. Den första modulen skickade upp av Ryssland 1998.
