Boende i staden vittnar om att regeringssoldater sent i torsdags kväll gick in i staden och hämtade tonåringar och män i 20-årsåldern.

- Allt vi hörde var pistolskott. De sköt ihjäl dem på fläcken, berättar en äldre man.

Soldaterna ska enligt invånarna ha genomfört räder i tre områden i staden. Att ett stort antal män dödats bekräftas av ett lokalt sjukhus, som enligt AFP tog emot 39 kroppar med färska skottskador dittransporterade av soldater. Militären förnekar uppgifterna.

Maiduguri är ett av Boko Harams starkaste fästen.

I samma stad sköts Mohammed Shuwa, tidigare högt uppsatt general, på fredagen ihjäl i sitt hem av beväpnade män. Militären anklagar Boko Haram för dådet.

I torsdags meddelade Nigerias regering att den ställer sig positiv till att föra dialog med den militanta islamiströrelsen. Beskedet kom efter att en man som säger sig representera Boko Haram trätt fram och förklarat att rörelsen är villig att sätta sig vid förhandlingsbordet, men mannens trovärdighet ifrågasätts.