Tusentals demonstranter samlades utanför japanska företag och industrier i mer än 50 kinesiska städer under helgen.
Tv-bilder från Guangzhou nära Hongkong visade hur över tusen personer brände japanska flaggor och stormade ett hotell nära det japanska konsulatet på söndagen.
I en annan stad i södra Kina, Shenzhen, sköt polis tårgas mot en folkmassa som påstods bestå av omkring 10 000 personer.
Hundratals protesterande samlades även vid Japans ambassad i Peking. De kastade vattenflaskor mot ambassaden och sjöng anti-japanska sånger.
Japans premiärminister Yoshihiko Noda kräver att Kina garanterar säkerheten för japanerna i landet.
- Den här situationen är en stor besvikelse, så vi har protesterat, sade Noda till en japansk tv-kanal.
Protester slås ofta effektivt ned i Kina, men under söndagen eskorterades många demonstranter av polis, och statliga medier kallade demonstrationerna ”rimliga”.
Kina blev ursinnigt när Japan för några dagar sedan köpte öarna som japanerna kallar Senkaku men som i Kina heter Diaoyu.
Båda länderna gör anspråk på öarna som tros ruva på värdefulla mineraler.
På söndagen dog också plötsligt det nyligen utsedda japanska sändebudet till Kina. Shinichi Nishimiya skulle flytta till Peking i oktober och ersätta Uichiro Niwa, som varnade för att ett köp av öarna kunde leda till en kris mellan länderna.
Japanska UD sade snabbt att ambassadör Nishimiyas död ”inte berodde på någon olycka eller anti-japanska demonstrationer” i Kina.
Relationen mellan Kina och Japan, världens andra och tredje största ekonomier, blir ofta ansträngda till följd av deras historiska rivalitet. Men länderna har även starka affärsrelationer.
