Lokala hälsovårdsmyndigheter varnar därför människor för att bada i förorenat vatten, även om inget tyder på att de som drabbats hittills har gjort det.
Amöban smittar inte från person till person, men dödligheten är drygt 98 procent för den som drabbas. Till en början är symtomen milda, som lättare huvudvärk, men de följs därefter av feber och svåra magsmärtor. Den drabbade dör oftast fem till sju dagar senare.
Detta är andra gången som Karachi, en stad med 18 miljoner invånare, drabbas av Naegleria fowleri. Första gången var 2006.
