Hotet gäller från fredag och hela december.
En talesman för säkerhetsdepartementet sade att den islamistisk gruppen tänker bryta sig in i och förstöra aktiemarknadens och bankerna databaser.
Departementet sade att det inte har något bevis som bekräftar hotet men att departementet gått ut med varningen av säkerhetsskäl.
Enligt regeringen är hotet en hämnd för att USA håller misstänkta terrorister fångna på Guantánamobasen på Kuba.
Al-Qaidahot mot internet
Den amerikanska regeringen har varnat den privata amerikanska finansmarknaden för ett al-Qaidahot om en angrepp mot aktiehandel och bankaffärer på nätet.
