Det innebär svåra störningar i tågtrafiken mellan Stockholm och Malmö.
SJ har inte lyckats få tag i tillräckligt många ersättningsbussar för att köra resenärerna på de avstängda sträckorna.
- Det blir orimligt långa väntetider, konstaterar Carl-Gustaf Olsson vid SJ:s pressjour till SvD.se.
Tågtrafiken stod vid 11-tiden på förmiddagen också stilla på sträckorna Kalmar-Alvesta-Borås, Nässjö-Jönköping och Borås-Varberg.
Även på en del av sträckan Göteborg-Karlstad ersätts trafiken med bussar.
Det var strax före klockan 12 fortfarande osäkert när tågtrafiken på de drabbade sträckorna kan komma igång igen.
Enligt prognoserna från tidigt i morse skulle tågen åter börja rulla mellan Nässjö och Alvesta vid lunchtid, medan trafiken mellan Alvesta och Hässleholm beräknades komma igång först sent på lördagskvällen.
- På vissa ställen har ledningsstolparna rasat, och det tar längre tid att reparera än om bara kontaktledningarna är nedrivna, säger Jonas Bengtsson på Banverket.
SJ uppmanar tågresenärer i södra Sverige som inte måste komma iväg idag att skjuta upp resan.
- Om det inte är nödvändigt att resa nu är det bättre att stanna hemma, säger Carl-Gustaf Olsson på SJ.
Samtidigt som många tåg ställdes in eller försenades på grund av stormen slutade högtalare och informationsskyltar på järnvägsstationerna att fungera.
Det var ett fel i en elcentral i Borlänge i vid sjutiden i morse som ledde till att Banverket drabbades av svåra it-problem under förmiddagen. Även Banverkets hemsida låg nere under förmiddagen.
Det gjorde det svårt för SJ och Banverket att nå ut med information till resenärerna om störningarna i trafiken.
- Strömmen i elcentralen är nu tillbaka men det tar ett par timmar att få igång systemen igen, sade Jonas Bengtsson på Banverkets pressjour vid 11.30-tiden.
Även vägtrafiken drabbades av stormen. Omkring 1 500 träd beräknas ha fallit ner över vägarna i södra Sverige när blåsten härjade i går kväll.
Det orsakade stopp i trafiken på ett 50-tal större vägar i Småland, Blekinge, norra Skåne och delar av västra Götaland.
Men träden forslades bort snabbt och redan i natt var vägarna öppna igen.
- Nu pågår efterröjningsarbetet, säger Thomas Andersson, pressekreterare på Vägverket.
Träd antas fortfarande spärra trafiken på ett okänt antal mindre vägar.
- Det handlar om grusvägar och andra vägar med mindre trafik, säger Thomas Andersson.




SJ: ”Det har varit besvärligt”




