Det hävdar flera riksdagsledamöter som nu anmäler Sahlin till konstitutionsutskottet. Anmälarna hävdar att Sahlin, genom att ge SKL i uppdrag att bara undersöka material från perioden den 2 oktober-6 december 1994, aktivt medverkar till att mörklägga vissa omständigheter kring Estonia som rör Försvarsmakten.

Försvaret har bekräftat att man utnyttjat Estonia för frakt av krigsmaterial. Det svenska försvaret, det finländska försvaret samt den finländska utredaren var de enda som de första åtta veckorna kände till den exakta positionen för fartygets förlisning.

Endast fyra dygn efter förlisningen togs bilder på vraket med en robotkamera. Där syns att räckena från insidan av Estonias ombordkörningsramp var avskurna och slängda på havsbotten utanför fartyget.

I september inledde justitiekansler Göran Lambertz en granskning av en Försvarsmaktens hantering av frågor kring Estonia, bland annat flera påstådda hemliga dykningar.